千岛企服·每日印尼（Indonesia-daily）讯，自2021年11月27日起在雅加达北部亚运村急诊医院接受治疗的一名患者被怀疑感染了奥密克戎，也就是第一例确诊前两周。截至目前，印尼已确认3例奥密克戎阳性病例和14例疑似病例。
卫生部周日 (12/19/2021) 的数据显示，印度尼西亚已确认三例携带 奥密克戎 变体的 Covid-19 病例。此外，根据SGTF（S基因靶标失败）检查结果，有14人疑似奥密克戎 。
第一例病例于 12 月 15 日从亚运村急诊医院 (RSDC) 工作人员的样本中得到确认，这些工作人员的首字母缩写为“N”，其样本自 12 月 8 日起采集，并于 12 月 12 日通过全基因组测序(WGS)进行分析。直到现在，还不知道是谁将 奥密克戎传染给了 亚运村急诊医院的工人。
N 接触史追踪检查了 169 个样品，其中 83 个被确认为非奥密克戎，5 个为阴性。而其他 76 个样本仍在基因测序。
追踪还发现，奥密克戎的疑似病例在发现N病例之前大约提前了两周。奥密克戎的疑似患者是来自尼日利亚的旅行者，于2021年11月27日至12月8日在亚运村急诊医院接受治疗。
11月28日，对该患者的标本进行WGS分析，但因CT值38或过高而失败。12 月 18 日，卫生部研发部与 SGTF 进行的复检显示，该患者疑似奥密克戎。
据Eijkman分子生物学研究中心高级研究员 Safarina G Malik 表示，如果CT高于30，则无法进行基因测序。高 CT 意味着病毒低，因此很难对基因组进行测序。
同时，12 月 17 日确诊的两例 奥密克戎 病例来自刚从国外返回并在亚运村急诊医院被隔离的印度尼西亚公民。一人从荷兰经新加坡返回，于2021年12月10日抵达雅加达。另一人从伦敦经多哈，最后于12月14日抵达雅加达。
